Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFDP00746 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFDP00746 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFDP00746 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFDP00746 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFDP00746 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFDP00746 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFDP00746 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms