Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG7O95352 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG7O95352 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG7O95352 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG7O95352 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG7O95352 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms