Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms