Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIAH2O43255 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms