Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSH5O43196 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSH5O43196 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSH5O43196 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSH5O43196 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSH5O43196 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSH5O43196 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSH5O43196 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSH5O43196 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSH5O43196 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSH5O43196 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSH5O43196 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSH5O43196 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms