Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM2O43147 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms