Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A1O14983 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A1O14983 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms