Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms