Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPA5E9PKD4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms