Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms