Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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