Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms