Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms