Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms