Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms