Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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