Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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