Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms