Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TLR1Q15399 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TLR1Q15399 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TLR1Q15399 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TLR1Q15399 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TLR1Q15399 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms