Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms