Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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COL4A6Q14031 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
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