Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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