Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC007614.2-201ENST00000569877 1851 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC00265-202ENST00000448955 468 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SNORA70.23-201ENST00000517218 151 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SNPHO15079 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SNPHO15079 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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