Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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