Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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