Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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DDX39BQ13838 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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DDX39BQ13838 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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DDX39BQ13838 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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DDX39BQ13838 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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DDX39BQ13838 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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