Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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