Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SP140Q13342 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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