Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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