Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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HOXA2O43364 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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HOXA2O43364 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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HOXA2O43364 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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HOXA2O43364 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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