Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FXNQ16595 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FXNQ16595 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FXNQ16595 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
FXNQ16595 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FXNQ16595 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FXNQ16595 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms