Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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