Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SSPNQ14714 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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