Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3BQ13214 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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