Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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