Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms