Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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