Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 FHL1-206ENST00000394153 2374 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC048383.1-201ENST00000558226 527 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RPL23AP90-201ENST00000603820 236 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms