Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CHAF1BQ13112 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CHAF1BQ13112 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CHAF1BQ13112 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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