Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 BDNF-216ENST00000532997 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TRHP20396 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 NEUROD6-201ENST00000297142 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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