Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SH3BP1Q9Y3L3 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SH3BP1Q9Y3L3 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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SH3BP1Q9Y3L3 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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