Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD42Q8N9B4 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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