Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NWD1Q149M9 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms