Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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