Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms