Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms