Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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CNTN3Q9P232 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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CNTN3Q9P232 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CNTN3Q9P232 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CNTN3Q9P232 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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CNTN3Q9P232 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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CNTN3Q9P232 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CNTN3Q9P232 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CNTN3Q9P232 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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