Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms