Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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