Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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